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http://rdu.unicesumar.edu.br/handle/123456789/6518
Tipo: | Artigo |
Título: | ALINHAMENTO DAS SEQÜÊNCIAS DA REGIÃO 3’ DO GENE C3-22 DE RHYNCHOSCIARA AMERICANA (DÍPTERA: SCIARIDAE) GERADAS POR SEQÜENCIAMENTO AUTOMÁTICO |
Autor(es): | SAEZ, Cláudia Regina das Neves VISACRE, Paulo Henrique Marquiori GOUVEIA, Fabiana de Souza FERNANDEZ, Maria Aparecida FIORINI, Adriana |
Resumo: | A reação de seqüenciamento de ácidos nucléicos permite determinar a ordem das bases nucleotídicas na molécula do DNA. Existem dois métodos de seqüenciamento, o automático e o manual, sendo o primeiro mais utilizado atualmente. O seqüenciamento automático é feito pela Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) utilizando, além dos deoxinucleotídeos normais (dNTPs), os dideoxinucleotídeos (ddNTPs), que são marcados com material fluorescente, uma cor para cada base, permitindo a detecção de diferentes fragmentos durante a migração pela eletroforese capilar. O seqüenciamento é apenas a primeira etapa de um processo cujo resultado final poderá resultar em novos métodos de análise sobre das características funcionais e estruturais do DNA. O gene C3-22 do sciarídeo Rhynchosciara americana está localizado em uma região amplificada do pufe de DNA C3. Estima-se que o produto do gene C3-22 seja uma proteína de secreção, que parece estar envolvida na formação do casulo pupal de R. americana. Aproximadamente 11 kb da região a montante e unidade da transcrição deste gene já foi seqüenciada e foram detectados recentemente por nosso grupo de pesquisa sítios intrínsecos de curvatura DNA, na zona de replicação a 5’ do gene, na região promotora e unidade de transcrição. Para completar o mapeamento destas características estruturais será necessário a obtenção da seqüência da região 3’ do gene C3-22. Portanto, o objetivo deste projeto é realizar o alinhamento das seqüências parciais já obtidas para esta região e determinar estratégias para o seqüenciamento dos gaps (interrupções da seqüência total). Análises de alinhamento preliminares serão realizadas com o auxílio de ferramentas online disponíveis no site do EMBL (http://www.ebi.ac.uk/embl/). Com a seqüência completa da região será possível a realização de novos estudos como a análise das características estruturais deste segmento amplificado ou outras análises baseadas na seqüência de nucleotídeos. |
Palavras-chave: | Seqüenciamento automático Rhynchosciara americana Gene C3-2 |
Idioma: | por |
País: | Brasil |
Editor: | UNIVERSIDADE CESUMAR |
Sigla da Instituição: | UNICESUMAR |
Tipo de Acesso: | Acesso Aberto |
URI: | http://rdu.unicesumar.edu.br/handle/123456789/6518 |
Data do documento: | 23-Out-2007 |
Aparece nas coleções: | V EPCC - Encontro Internacional de Produção Científica ( 23 a 26 de Outubro de 2007) |
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