EVENTOS EPCC - Encontro Internacional de Produção Científica V EPCC - Encontro Internacional de Produção Científica ( 23 a 26 de Outubro de 2007)

Tipo:	Artigo
Título:	ALINHAMENTO DAS SEQÜÊNCIAS DA REGIÃO 3’ DO GENE C3-22 DE RHYNCHOSCIARA AMERICANA (DÍPTERA: SCIARIDAE) GERADAS POR SEQÜENCIAMENTO AUTOMÁTICO
Autor(es):	SAEZ, Cláudia Regina das Neves VISACRE, Paulo Henrique Marquiori GOUVEIA, Fabiana de Souza FERNANDEZ, Maria Aparecida FIORINI, Adriana
Resumo:	A reação de seqüenciamento de ácidos nucléicos permite determinar a ordem das bases nucleotídicas na molécula do DNA. Existem dois métodos de seqüenciamento, o automático e o manual, sendo o primeiro mais utilizado atualmente. O seqüenciamento automático é feito pela Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) utilizando, além dos deoxinucleotídeos normais (dNTPs), os dideoxinucleotídeos (ddNTPs), que são marcados com material fluorescente, uma cor para cada base, permitindo a detecção de diferentes fragmentos durante a migração pela eletroforese capilar. O seqüenciamento é apenas a primeira etapa de um processo cujo resultado final poderá resultar em novos métodos de análise sobre das características funcionais e estruturais do DNA. O gene C3-22 do sciarídeo Rhynchosciara americana está localizado em uma região amplificada do pufe de DNA C3. Estima-se que o produto do gene C3-22 seja uma proteína de secreção, que parece estar envolvida na formação do casulo pupal de R. americana. Aproximadamente 11 kb da região a montante e unidade da transcrição deste gene já foi seqüenciada e foram detectados recentemente por nosso grupo de pesquisa sítios intrínsecos de curvatura DNA, na zona de replicação a 5’ do gene, na região promotora e unidade de transcrição. Para completar o mapeamento destas características estruturais será necessário a obtenção da seqüência da região 3’ do gene C3-22. Portanto, o objetivo deste projeto é realizar o alinhamento das seqüências parciais já obtidas para esta região e determinar estratégias para o seqüenciamento dos gaps (interrupções da seqüência total). Análises de alinhamento preliminares serão realizadas com o auxílio de ferramentas online disponíveis no site do EMBL (http://www.ebi.ac.uk/embl/). Com a seqüência completa da região será possível a realização de novos estudos como a análise das características estruturais deste segmento amplificado ou outras análises baseadas na seqüência de nucleotídeos.
Palavras-chave:	Seqüenciamento automático Rhynchosciara americana Gene C3-2
Idioma:	por
País:	Brasil
Editor:	UNIVERSIDADE CESUMAR
Sigla da Instituição:	UNICESUMAR
Tipo de Acesso:	Acesso Aberto
URI:	http://rdu.unicesumar.edu.br/handle/123456789/6518
Data do documento:	23-Out-2007
Aparece nas coleções:	V EPCC - Encontro Internacional de Produção Científica ( 23 a 26 de Outubro de 2007)

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