ANÁLISE DE BIOINFORMÁTICA PARA DETERMINAÇÃO DE ENDONUCLEASES PARA O GENE BRCA1 EM CÃES

Abstract

A proteína BRCA1 está associada a propagação de erros gênicos por perda de controle do ciclo celular e apoptose, resultando em aumento descontrolado da taxa de proliferação celular. Em cães, os tumores de mama são as neoplasias mais comuns, e o gene BRCA1 torna- se um forte candidato a estudos moleculares, uma vez que informações de polimorfismos ainda são poucas nesta espécie. Uma maneira eficiente de validação de polimorfismos genético em populações grandes é a técnica de RFLP (Restriction Fragment Length Polymorfism), entretanto está técnica depende da escolha correta das endonucleases. Deste modo, com esta pesquisa realizamos a análise de bioinformática no gene BRCA1 e determinamos possíveis sítios de restrição e endonucleases adequadas. Para tal, utilizamos ferramentas de alinhamento genético de múltiplas sequências (Needleman-Wunsch Global Align Nucleotide Sequences) para alinhamento de regiões de éxons. Após, foi realizada a detecção de sítios de restrição das regiões polimórficas encontradas por meio do software Restriction Mapper3. As endonucleases, sítio de corte e fragmentos esperados foram organizados em forma de tabela, como base de pesquisa para futuros estudos.